与Seismic Unix类似,Madagascar也是一款地震数据处理软件,其开发者众多,内置的软件也非常多, 缺点就是代码注释比较少,不容易懂。给的示例虽多,但也不容易懂,对于初学者而言十分困难。

下载最新的Release版本:http://github.com/ahay/src.git

Linux 下安装Madagascar

安装依赖包

# 必须安装的依赖包
$ sudo apt install libxaw7-dev
# 建议安装的依赖包
$ sudo apt install freeglut3-dev
$ sudo apt install libnetpbm10-dev
$ sudo apt install libgd-dev  
$ sudo apt install libplplot-dev
$ sudo apt install libavcodec-dev
$ sudo apt install libcairo2-dev
$ sudo apt install libjpeg-dev
$ sudo apt install swig
$ sudo apt install python-dev
$ sudo apt install python-numpy
$ sudo apt install g++
$ sudo apt install gfortran
$ sudo apt install libopenmpi-dev
$ sudo apt install libfftw3-dev
$ sudo apt install libsuitesparse-dev
# 不建议安装的包
$ sudo apt install python-epydoc
# 安装 octave API 需要下面的包
$ sudo apt install octave liboctave-dev

编译,安装

$ git clone https://github.com/ahay/src.git madagascar-2.0
$ cd madagascar-2.0
$ ./configure API=c++,f90,python,matlab,octave --prefix=/home/lloyd/rsf2.0 # 额外安装C++,Fortran, Python, Matlab, Octave 五个API
$ make
$ make install

若出现checking for mkoctfile ... (cached) no的错误,主要原因是缺liboctave-dev,重新安装liboctave-dev即可。

配置环境变量

~/.bashrc中加入如下语句以配置环境变量。

# Madagascar 2.0
export RSFROOT=/home/lloyd/rsf2.0
source $RSFROOT/share/madagascar/etc/env.sh

macOS High Sierra 下安装Madagascar

安装依赖包

  • 安装MacPorts,进官网,下载安装文件打开安装即可。
  • 安装Xcode,从App Store里安装即可
  • X11,可通过安装Xquartz来获得X11,进官网下载安装文件安装即可

    ## FFTW
    $ sudo port install fftw-3-single
    $ sudo port install fftw-3 +gfortran
    ## MPI
    sudo port install openmpi
    sudo port select --set mpi openmpi-mp-fortran
    ## ppmpen
    sudo port install libnetpbm
    

编译,安装

macOS 安装 Matlab API 限制比较多,首先需要在~/.bash_profile中添加 Matlab 的安装路径。

# MATLAB 20XXX, XXX 为版本号,比如 Matlab 2018a etc.
export PATH=$PATH:/Applications/MATLAB_R20XXX.app/bin
## 在Madagascar 源码的根目录下执行下列操作
$ ./configure CC=clang CXX=clang++ API=python,f90,matlab,octave --prefix=/Users/lloyd/rsf # 额外安装C++,Python,Fortran,Matlab,Octave五个API
$ make
$ make install

另外,需要考虑 Matlab mex 支持的编译器,比如最新的 macOS High Sierra 系统中 Xcode 的版本为9.X,而 Matlab 2016x 等不支持该版本的编译器。关于 Matlab 版本与对应的 Xcode 版本对应关系详见: https://www.mathworks.com/support/sysreq/previous_releases.html

配置环境变量

~/.bash_profile中加入如下语句以配置环境变量。

# Madagascar 2.0
export RSFROOT=/Users/lloyd/rsf
source $RSFROOT/share/madagascar/etc/env.sh

参考

修订历史

  • 2016-05-22: 初稿;
  • 2017-07-18: 更新至 madagascar2.0;
  • 2018-04-28: 更新 macOS High Sierra 下安装 Madagascar;
  • 2018-05-20: 更新 Linux 安装 Matlab API;
  • 2018-05-22: 更新 macOS High Sierra 下安装 Matlab API;
  • 2018-08-12:新增 Octave API